Erejük csak a Kriptonról származó lényekre hat. Minden kriptonira ugyanolyan hatással van.
Zöld kriptonit
A Kriptonról származó játékost legyengíti, majdnem tehetetlenné teszi. Ereje meggyengül, de nem vész el.
Kék kriptonit
Elveszi játékosa képességeit, halandó emberré téve őt. Míg közelében van ez a kő, nincs szuperereje.
Vörös kriptonit
Viselője megvadul, tudata legyengül, gondolkodása visszaesik.
Fekete kriptonit
Az egyetlen kriptoni kristály, mely emberre is hat. Használatakor a játékos személyisége ketté válik - egy jó és egy rossz oldalra. Ez a kristály akkor jön jól, ha Doomsday-t szeretnénk megtalálni valakiben. Csak a 8. szinttől használható.
Fehér kriptonit
Bármilyen növényt azonnal elpusztít, legyen az kriptoni, vagy sem.
Ezüst kriptonit
Paranoiás tüneteket okoz viselőjének. A játékos rengeteg dolgot beképzel, nem bízik meg senkiben, és megpróbálja helyrehozni az elrontottnak hitt dolgokat.
Narancs kriptonit
Még erősebbé teszi viselőjét. Erősebb lesz, mint valaha. Csak a 8. szinttől használható.